Finnmark fylkeskommune er politisk styrt gjennom fylkestinget, med folkevalgte som velges ved kommune- og fylkestingsvalgene hvert fjerde år. Fylkesordfører er Runar Sjåstad (Ap).
Fylkeskommunen er det mellomste av de tre forvaltningsnivåene i Norge. Fylkestinget er fylkeskommunens øverste myndighet.