Fylkeskommunen er politisk styrt gjennom fylkestinget, som blir valgt hvert 4. år samtidig med kommunestyrene. Finnmark fylkesting består av 35 representanter. Her avgjøres alle viktige saker for fylkeskommunens drift og økonomi.
Fylkesutvalget er fylkestingets arbeidsutvalg, og har 11 medlemmer.
Kompetanseutvalget består av 13 representanter og behandler saker som angår videregående opplæring, tannhelse og forbrukersaker. Utvalget ledes av en fylkesråd/heldagspolitiker.
Kultur-, nærings- og samferdselsutvalget består av 13 representanter og behandler saker som angår kultur, idrett, næring og samferdsel. Utvalget ledes av en fylkesråd/heldagspolitiker.